Rupert Hausner wurde 1956 in St. Vit im Kreis Rheda-Wiedenbrück geboren und ist in Dortmund und Pforzheim aufgewachsen. Nach Abitur, Wehrdienst, einem Sozialen Jahr und Jobs im Straßenbau, studierte er in Reutlingen Sonderpädagogik und begann parallel dazu als Schauspieler zu arbeiten. Von 1984 bis 1995 war er regelmäßiger Gast am Theater Lindenhof Melchingen, am Theater Chawwerusch Herxheim, am Kindertheater Patati Patata Reutlingen und am Landestheater Tübingen. Von 1999 bis 2022 war Rupert Hausner festes Ensemblemitglied am Landestheater Tübingen, wo er in erster Linie für junges Publikum spielte.
Neben vielen Stückentwicklungen und Uraufführungen erarbeitete er auch mehrere Solostücke wie „Flasche leer" von Thilo Reffert, das er 225 Mal in Schulklassen zeigte. Außerdem spielte er häufig in musikalischen Produktionen von Heiner Kondschak mit, z.B. als Kuno, der Wolf, im Tübinger Kult-Musical „Dogs". Gastspieleinladungen führten ihn zu zahlreichen Festivals, so gastierte er u.a. mit „Die fürchterlichen Fünf" von Heiner Kondschak nach Wolf Erlbruch in Kanada und Polen oder mit „Ein Tag wie das Leben", einem Zweipersonenstück ohne Worte, in Südkorea.
Zu seinen bekannten Rollen gehörten Rupert von Schroffenstein in „Die Familie Schroffenstein", König Ignatz in „Yvonne, die Burgunderprinzessin", Hildegunst von Mythenmetz in „Ensel und Krete" von Walter Moers, Merlin in „Artus", Hagen in „Die Nibelungen", Puck in „Ein Sommernachtstraum", Coppelius, Coppola und Prof. Spalanzani in „Der Sandmann" von E.T.A. Hoffmann und viele andere mehr.
Außerdem war Rupert Hausner von Beginn an Mitglied der legendären „Randgruppencombo", die zwischen 2000 und 2022 in über 200 Konzerten die Lieder von Gerhard Gundermann im Südwesten Deutschlands bekannt gemacht hat und regelmäßig auch in Berlin, Leipzig, Erfurt und Dresden auftrat.
Seit der Spielzeit 2022/2023 arbeitet er freischaffend. Zuletzt spielte er Romulus in „Romulus der Große" von Friedrich Dürrenmatt am Theater Reutlingen Die Tonne.
Als Diener Johann in „Drei Männer im Schnee" war er 2022/2023 zum ersten Mal an der Komödie im Marquardt zu erleben. In dieser Saison gehört er zum Ensemble von „Loriots Dramatische Werke".